Biblioteka Muzeum i Instytutu Zoologii PAN posiada bogaty księgozbiór zoologiczny, gromadzi literaturę polską i zagraniczną z zakresu zoologii ze szczególnym uwzględnieniem systematyki oraz zoogeografii, literaturę entomologiczną i ornitologiczną. Ostatnio również wydawnictwa dotyczące genetyki i biologii molekularnej.

Źródłami gromadzenia księgozbioru są: zakup, prenumerata, wymiana wydawnictw, dary. Większość zbiorów stanowią pozycje/wydawnictwa zagraniczne, pozyskiwane na drodze wymiany. Wymiana prowadzona jest z ok. 700 placówkami zagranicznymi.

Stan naszego księgozbioru na 31.12.2011 r., to ogółem 247 377 wol., w tym:

• czasopisma: 119 952 wol.
• książki: 45 799 wol.
• nadbitki: 74 065 wol.
• zbiory specjalne:
  • zbiory kartograficzne: 4.955 jedn.
  • zbiory fonograficzne: 134 jedn.
  • 1272 starodruków.

Najstarszy posiadany przez nas starodruk, to: „O ziołach tutecznych y zamorskich y o moczy ich, a ktemu kxięgi lekarskie, wedle regestru niżey napisanego wszem wielmi użyteczne (…)” 
Hieronima Spiczyńskiego z roku 1542.